Кристиан Нобоа родился в Гуаякиле, Эквадор. В казанский «Рубин» перешел зимой 2007 года из эквадорского «Эмелека», подписав 5-летний контракт. В дебютном матче против «Ростова» забил гол в свои ворота. В сезоне-2007 сыграл 13 матчей.

Нобоа дебютировал в молодежной сборной Эквадора в 18 лет. Впоследствии неоднократно получал вызов в первую сборную, но на поле не выходил.

Нобоа – первый легионер из Эквадора в истории российского футбола.

В сезоне 2008 года стал одним из основных игроков клуба. Блестяще исполнял штрафные. За три тура до конца чемпионата России вместе с «Рубином» официально стал чемпионом страны.